Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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