Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3BO95985 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TOP3BO95985 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TOP3BO95985 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TOP3BO95985 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TOP3BO95985 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOP3BO95985 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TOP3BO95985 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TOP3BO95985 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOP3BO95985 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms