Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB11O95342 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms