Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCELO95171 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCELO95171 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCELO95171 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCELO95171 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCELO95171 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCELO95171 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCELO95171 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCELO95171 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCELO95171 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCELO95171 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCELO95171 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCELO95171 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCELO95171 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCELO95171 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms