Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGR5O75473 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGR5O75473 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGR5O75473 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR5O75473 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR5O75473 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR5O75473 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR5O75473 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR5O75473 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR5O75473 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR5O75473 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR5O75473 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR5O75473 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGR5O75473 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGR5O75473 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGR5O75473 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGR5O75473 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGR5O75473 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGR5O75473 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGR5O75473 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGR5O75473 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGR5O75473 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGR5O75473 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGR5O75473 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR5O75473 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms