Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA4O75335 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms