Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms