Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG13O75143 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG13O75143 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG13O75143 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG13O75143 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG13O75143 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG13O75143 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG13O75143 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG13O75143 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG13O75143 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG13O75143 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG13O75143 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG13O75143 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG13O75143 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms