Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEC1O60732 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEC1O60732 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEC1O60732 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEC1O60732 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEC1O60732 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEC1O60732 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEC1O60732 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEC1O60732 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEC1O60732 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEC1O60732 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGEC1O60732 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms