Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.34
ABCC9O60706 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms