Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCRIPO60506 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms