Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KIAA0556O60303 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms