Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK2O60296 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms