Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX16O60231 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX16O60231 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX16O60231 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX16O60231 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX16O60231 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX16O60231 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX16O60231 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX16O60231 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DHX16O60231 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX16O60231 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX16O60231 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms