Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX6O43752 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX6O43752 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX6O43752 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX6O43752 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX6O43752 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX6O43752 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX6O43752 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX6O43752 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX6O43752 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX6O43752 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX6O43752 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX6O43752 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX6O43752 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX6O43752 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX6O43752 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX6O43752 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms