Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms