Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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HOXA3O43365 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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HOXA3O43365 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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HOXA3O43365 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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