Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNMO15061 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNMO15061 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNMO15061 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNMO15061 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNMO15061 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNMO15061 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNMO15061 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNMO15061 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNMO15061 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNMO15061 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNMO15061 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNMO15061 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNMO15061 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNMO15061 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNMO15061 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNMO15061 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNMO15061 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNMO15061 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms