Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETD1AO15047 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms