Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APAF1O14727 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APAF1O14727 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APAF1O14727 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
APAF1O14727 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APAF1O14727 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APAF1O14727 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APAF1O14727 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APAF1O14727 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
APAF1O14727 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
APAF1O14727 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APAF1O14727 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
APAF1O14727 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APAF1O14727 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APAF1O14727 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APAF1O14727 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APAF1O14727 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APAF1O14727 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
APAF1O14727 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
APAF1O14727 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
APAF1O14727 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APAF1O14727 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APAF1O14727 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APAF1O14727 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms