Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CUX2O14529 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CUX2O14529 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CUX2O14529 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CUX2O14529 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CUX2O14529 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CUX2O14529 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CUX2O14529 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CUX2O14529 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CUX2O14529 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CUX2O14529 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CUX2O14529 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CUX2O14529 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CUX2O14529 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CUX2O14529 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CUX2O14529 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CUX2O14529 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CUX2O14529 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CUX2O14529 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CUX2O14529 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CUX2O14529 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CUX2O14529 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CUX2O14529 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CUX2O14529 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CUX2O14529 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CUX2O14529 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CUX2O14529 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CUX2O14529 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CUX2O14529 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CUX2O14529 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CUX2O14529 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CUX2O14529 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CUX2O14529 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CUX2O14529 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CUX2O14529 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CUX2O14529 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CUX2O14529 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CUX2O14529 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CUX2O14529 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CUX2O14529 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CUX2O14529 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CUX2O14529 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CUX2O14529 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CUX2O14529 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CUX2O14529 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CUX2O14529 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CUX2O14529 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CUX2O14529 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CUX2O14529 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CUX2O14529 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CUX2O14529 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CUX2O14529 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CUX2O14529 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CUX2O14529 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CUX2O14529 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CUX2O14529 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CUX2O14529 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CUX2O14529 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CUX2O14529 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CUX2O14529 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CUX2O14529 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CUX2O14529 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CUX2O14529 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CUX2O14529 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CUX2O14529 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CUX2O14529 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CUX2O14529 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CUX2O14529 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
CUX2O14529 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
CUX2O14529 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CUX2O14529 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CUX2O14529 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CUX2O14529 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CUX2O14529 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CUX2O14529 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CUX2O14529 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CUX2O14529 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CUX2O14529 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CUX2O14529 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CUX2O14529 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CUX2O14529 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CUX2O14529 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms