Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRIT1O00522 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms