Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCL9O00512 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCL9O00512 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCL9O00512 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL9O00512 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL9O00512 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL9O00512 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL9O00512 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL9O00512 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL9O00512 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL9O00512 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCL9O00512 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCL9O00512 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCL9O00512 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCL9O00512 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCL9O00512 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCL9O00512 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCL9O00512 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCL9O00512 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCL9O00512 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCL9O00512 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCL9O00512 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BCL9O00512 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCL9O00512 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCL9O00512 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCL9O00512 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCL9O00512 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCL9O00512 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCL9O00512 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCL9O00512 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCL9O00512 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
BCL9O00512 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCL9O00512 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCL9O00512 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCL9O00512 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCL9O00512 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCL9O00512 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCL9O00512 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BCL9O00512 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCL9O00512 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCL9O00512 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCL9O00512 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCL9O00512 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCL9O00512 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCL9O00512 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms