Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1D1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1D1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1D1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1D1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1D1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1D1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1D1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1D1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C1D1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C1D1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1D1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1D1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1D1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1D1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1D1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1D1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1D1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1D1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C1D1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C1D1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1D1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1D1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1D1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H7C1D1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1D1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1D1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1D1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms