Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C0C1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C0C1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C0C1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C0C1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C0C1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C0C1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C0C1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C0C1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C0C1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C0C1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C0C1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C0C1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C0C1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C0C1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms