Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PMD0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PMD0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PMD0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PMD0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PMD0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PMD0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PMD0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PMD0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PMD0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PMD0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PMD0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PMD0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PMD0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PMD0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PMD0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PMD0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PMD0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PMD0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PMD0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PMD0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PMD0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PMD0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PMD0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PMD0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PMD0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PMD0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PMD0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PMD0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PMD0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PMD0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PMD0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PMD0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PMD0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms