Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HHLA1C9JL84 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms