Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms