Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF233A6NK53 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms