Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms