Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms