Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPA6NDG6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPA6NDG6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms