Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms