Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3B2A6NCE7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms