Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms