Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM30A4D0T7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms