Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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