Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP3K4Q9Y6R4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms