Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms