Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX8Q9Y5X2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX8Q9Y5X2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX8Q9Y5X2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX8Q9Y5X2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX8Q9Y5X2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX8Q9Y5X2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX8Q9Y5X2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms