Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I2

PCDHA10, Protocadherin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA10Q9Y5I2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA10Q9Y5I2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA10Q9Y5I2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms