Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIF3AQ9Y2N7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIF3AQ9Y2N7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms