Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC8Q9Y2L5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms