Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GNEQ9Y223 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNEQ9Y223 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms