Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms