Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP164Q9UPV0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CEP164Q9UPV0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CEP164Q9UPV0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms