Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms