Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms