Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms