Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C4Q9UKN8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C4Q9UKN8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms